Laboratorium Analiz Genetycznych

bt_bb_section_bottom_section_coverage_image
https://slm.sum.edu.pl/wp-content/uploads/2023/11/image000000.jpg

Informacje podstawowe

Laboratorium Analiz Genetycznych służy prowadzeniu badań zarówno naukowych jak i komercyjnych, w rożnych obszarach medycyny.  Dzięki sprzętowi najnowszej generacji oraz automatyzacji całego procesu począwszy od pobrania materiału badania mogą zostać przeprowadzone w jednym miejscu przy jednoczesnym obniżeniu ryzyka powstania błędów. Główne prace badawcze skupiają się na:

  • Analizie genomu człowieka, wpływie mutacji, polimorfizmów oraz czynników epigenetycznych na występowanie chorób nowotworowych.
  • Wykorzystaniu metod sekwencjonowania w ocenie indywidualnych zamian w genomie  (Sanger).
  • W ramach Laboratorium Analiz Genetycznych prowadzimy także szeroki zakres usług związany z analizą zmian ekspresji genów, zarówno w próbkach pobranych od pacjentów, jak i również w liniach komórek hodowanych w warunkach in vitro.
  • Nasze prace badawcze oparte są także o badania molekularne z zakresu oceny aktywności biologicznej nowych substancji leczniczych oraz ich formulacji, a także monitorowania efektów farmakoterapii na poziomie molekularnym.
  • Dodatkowym aspektem pracy Laboratorium jest ocena zmian ekspresji genów w komórkach poddanych modyfikacjom genetycznym oraz w komórkach macierzystych.

Wyposażenie laboratorium

  1. Analizator sekwencji kwasów nukleinowych Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer
  2. Termocykler do ilościowego i jakościowego PCR w czasie rzeczywistym (IVD) Thermo Fischer Scientific LifeTechnologies: Quant Studio 7 Pro Dx
  3. Aparat do oceny jakości i integralności kwasów nukleinowych i białek – Agilent 2100 Bioanalyzer
  4. Systemy do obrazowania żeli w fluoroscencji i świetle widzialnym oraz chemiluminescencji Thermo Fisher Scientific: iBright FL1500
  5. Termomikser z dwoma blokami i pokrywą Eppendorf: ThermoMixer C
  6. System do próżniowego zagęszczania próbek Eppendorf: Concentrator Plus
  7. Thermo Fisher Scientific – NanoDrop OneC
  8. System do rozdziału amplikonów PCR w środowisku żeli agarozowych – Biorad Sub-Cell GT
  9. Automatyczny system do izolacji kwasów nukleinowych: MagCore Plus II
  10. Bloki grzewcze Biosan CH 3-150
  11. Homogenizator Omni GLH
  12. Homogenizator z chłodzeniem Precellys Evolution Bertin
20231109_110525
20231109_110002
20231109_105914
20231109_105304
20231109_105733
20231109_105840
20231109_110835
20231109_110659

Propozycje badań Laboratorium Analiz Genetycznych w ramach Silesia LabMed

https://slm.sum.edu.pl/wp-content/uploads/2022/11/louis-reed-pwcKF7L4-no-unsplash-scaled.jpg
  1. Izolacja kwasów nukleinowych, zarówno DNA jak i RNA z materiałów, różnego pochodzenia (krew, hodowle komórkowe, płyny ustrojowe itp.).
  2. Ocena jakościowa oraz ilościowa uzyskanych ekstraktów.
  3. Analiza mutacji oraz polimorfizmów wybranych genów.
  4. Analiza ekspresji z wykorzystaniem łańcuchowej reakcji polimerazy z odwrotną transkrypcją w czasie rzeczywistym.
  5. Analiza metylacji genów.
  6. Sekwencjonowanie metodą Sangera.
  7. Projektowanie starterów do analizy ekspresji genów oraz sekwencjonowania.
  8. Analiza bioinformatyczna oraz statystyczna wyników uzyskanych z reakcji PCR oraz sekwencjonowania Sangera.
bt_bb_section_top_section_coverage_image

Plany Rozwojowo-Badawcze

  • Wykrywanie polimorfizmów i mutacji DNA wywołanych czynnikami endogennymi.
  • Badania z zakresu epigenetyki (głównie metylacji DNA) w  komórkach nowotworowych.
  • Badanie wpływu leków, substancji leczniczych oraz ich formulacji, substancji pochodzenia naturalnego oraz ich pochodnych na zmianę poziomu ekspresji genów w komórkach nowotworowych oraz w różnych jednostkach chorobowych.
  • Ocena efektywności wyciszania genów metodami inżynierii genetycznej w komórkach macierzystych oraz nowotworowych.
  • Ocena wpływu badanych związków na poziom ekspresji genów związanych z angiogenezą oraz metastazą w komórkach tworzących mikrośrodowisko guza.
https://slm.sum.edu.pl/wp-content/uploads/2020/03/hero-about-us-1.jpg
bt_bb_section_top_section_coverage_image